產(chǎn)品介紹

     轉(zhuǎn)錄組研究是理解生命過程必不可少的工具之一，然而二代RNA-Seq不能準(zhǔn)確得到或組裝出完整轉(zhuǎn)錄本，無法識別Isoform、同源基因、超家族基因、等位基因表達的轉(zhuǎn)錄本，使人們難以理解這一生命活動更深層次的含義。全長轉(zhuǎn)錄組測序，無需打斷，基于三代測序平臺直接獲取轉(zhuǎn)錄本的5ˊ到3ˊ高質(zhì)量全長序列。

產(chǎn)品特點

     相比二代轉(zhuǎn)錄組測序，可準(zhǔn)確鑒定基因的可變剪接、可變多聚腺苷酸化（alternative polyadenylation, APA）、融合基因、基因家族和非編碼RNA等信息。基于nanopore三代測序平臺進行全長轉(zhuǎn)錄組測序，還可實現(xiàn)基因和轉(zhuǎn)錄本表達水平準(zhǔn)確定量。

分析方法

     首先通過全長序列識別、全長序列polish得到一致性序列和一致性序列去冗余，再進行后續(xù)的Isoform、同源基因、基因家族、SSR、可變剪接、lncRNA等分析。

分析內(nèi)容

     轉(zhuǎn)錄本全長序列統(tǒng)計、可變剪接分析、轉(zhuǎn)錄本融合發(fā)現(xiàn)、可變多聚腺苷酸化、SSR分析、

     新基因編碼區(qū)序列預(yù)測、轉(zhuǎn)錄因子分析、LncRNA預(yù)測、差異表達基因篩選、差異表達基因注釋和富集分析、差異表達基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)、GSEA分析。

分析結(jié)果示例圖